Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3K8

Optn, Optineurin, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OptnQ8K3K8 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
OptnQ8K3K8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
OptnQ8K3K8 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms