Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ncapd2Q8K2Z4 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ncapd2Q8K2Z4 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ncapd2Q8K2Z4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms