Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brd3Q8K2F0 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms