Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

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Length 984 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nek9Q8K1R7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Nek9Q8K1R7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
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