Protein–RNA interactions for Protein: Q8K158

Cnppd1, Protein CNPPD1, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnppd1Q8K158 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnppd1Q8K158 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnppd1Q8K158 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnppd1Q8K158 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnppd1Q8K158 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnppd1Q8K158 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Cnppd1Q8K158 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnppd1Q8K158 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnppd1Q8K158 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnppd1Q8K158 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnppd1Q8K158 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnppd1Q8K158 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnppd1Q8K158 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cnppd1Q8K158 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Cnppd1Q8K158 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnppd1Q8K158 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnppd1Q8K158 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnppd1Q8K158 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnppd1Q8K158 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnppd1Q8K158 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cnppd1Q8K158 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
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Cnppd1Q8K158 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnppd1Q8K158 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnppd1Q8K158 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnppd1Q8K158 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cnppd1Q8K158 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Cnppd1Q8K158 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Cnppd1Q8K158 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnppd1Q8K158 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Cnppd1Q8K158 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cnppd1Q8K158 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Cnppd1Q8K158 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cnppd1Q8K158 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Cnppd1Q8K158 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnppd1Q8K158 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnppd1Q8K158 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnppd1Q8K158 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cnppd1Q8K158 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnppd1Q8K158 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnppd1Q8K158 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnppd1Q8K158 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnppd1Q8K158 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnppd1Q8K158 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnppd1Q8K158 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnppd1Q8K158 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnppd1Q8K158 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnppd1Q8K158 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnppd1Q8K158 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cnppd1Q8K158 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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