Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pkn3Q8K045 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms