Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZW4

Cpne5, Copine-5, mousemouse

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne5Q8JZW4 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne5Q8JZW4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne5Q8JZW4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms