Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIE6

Copa, Coatomer subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CopaQ8CIE6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CopaQ8CIE6 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CopaQ8CIE6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms