Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHI8

Ep400, E1A-binding protein p400, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 3,072 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ep400Q8CHI8 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ep400Q8CHI8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ep400Q8CHI8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms