Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Rab11fip3Q8CHD8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab11fip3Q8CHD8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab11fip3Q8CHD8 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab11fip3Q8CHD8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab11fip3Q8CHD8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab11fip3Q8CHD8 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab11fip3Q8CHD8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab11fip3Q8CHD8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab11fip3Q8CHD8 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab11fip3Q8CHD8 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab11fip3Q8CHD8 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab11fip3Q8CHD8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab11fip3Q8CHD8 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Rab11fip3Q8CHD8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab11fip3Q8CHD8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab11fip3Q8CHD8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab11fip3Q8CHD8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab11fip3Q8CHD8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab11fip3Q8CHD8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab11fip3Q8CHD8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab11fip3Q8CHD8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab11fip3Q8CHD8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab11fip3Q8CHD8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab11fip3Q8CHD8 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab11fip3Q8CHD8 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab11fip3Q8CHD8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab11fip3Q8CHD8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab11fip3Q8CHD8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab11fip3Q8CHD8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rab11fip3Q8CHD8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
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