Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFE2

Hpf1, Histone PARylation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hpf1Q8CFE2 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Hpf1Q8CFE2 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Hpf1Q8CFE2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms