Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

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Length 459 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Snx8Q8CFD4 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms