Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
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Usp27Q8CEG8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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Usp27Q8CEG8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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Usp27Q8CEG8 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Usp27Q8CEG8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
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Usp27Q8CEG8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
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Usp27Q8CEG8 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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Usp27Q8CEG8 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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Usp27Q8CEG8 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
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Usp27Q8CEG8 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Usp27Q8CEG8 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
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