Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDL9

Ccdc87, Coiled-coil domain-containing protein 87, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc87Q8CDL9 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ccdc87Q8CDL9 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ccdc87Q8CDL9 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms