Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ufl1Q8CCJ3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ufl1Q8CCJ3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms