Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBD1

Nrip1, Nuclear receptor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip1Q8CBD1 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Nrip1Q8CBD1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nrip1Q8CBD1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms