Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBC6

Lrrn3, Leucine-rich repeat neuronal protein 3, mousemouse

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Length 707 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn3Q8CBC6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Lrrn3Q8CBC6 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Lrrn3Q8CBC6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms