Protein–RNA interactions for Protein: Q8CBA2

Slfn5, Schlafen family member 5, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfn5Q8CBA2 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn5Q8CBA2 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn5Q8CBA2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn5Q8CBA2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn5Q8CBA2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn5Q8CBA2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn5Q8CBA2 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Slfn5Q8CBA2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slfn5Q8CBA2 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slfn5Q8CBA2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slfn5Q8CBA2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slfn5Q8CBA2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slfn5Q8CBA2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slfn5Q8CBA2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slfn5Q8CBA2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Slfn5Q8CBA2 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Slfn5Q8CBA2 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Slfn5Q8CBA2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Slfn5Q8CBA2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slfn5Q8CBA2 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Slfn5Q8CBA2 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Slfn5Q8CBA2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Slfn5Q8CBA2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.4 ms