Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAT8

Fbxo48, F-box only protein 48, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo48Q8CAT8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Fbxo48Q8CAT8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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