Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9S8

Atg4a, Cysteine protease ATG4A, mousemouse

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4aQ8C9S8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Atg4aQ8C9S8 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg4aQ8C9S8 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg4aQ8C9S8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg4aQ8C9S8 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg4aQ8C9S8 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg4aQ8C9S8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg4aQ8C9S8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg4aQ8C9S8 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg4aQ8C9S8 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg4aQ8C9S8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
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Atg4aQ8C9S8 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg4aQ8C9S8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg4aQ8C9S8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
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Atg4aQ8C9S8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg4aQ8C9S8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg4aQ8C9S8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg4aQ8C9S8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg4aQ8C9S8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Atg4aQ8C9S8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg4aQ8C9S8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Atg4aQ8C9S8 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Atg4aQ8C9S8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Atg4aQ8C9S8 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg4aQ8C9S8 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
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Atg4aQ8C9S8 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg4aQ8C9S8 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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Atg4aQ8C9S8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
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Atg4aQ8C9S8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
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Atg4aQ8C9S8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4aQ8C9S8 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
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Atg4aQ8C9S8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4aQ8C9S8 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4aQ8C9S8 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4aQ8C9S8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4aQ8C9S8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4aQ8C9S8 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4aQ8C9S8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4aQ8C9S8 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4aQ8C9S8 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4aQ8C9S8 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4aQ8C9S8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg4aQ8C9S8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atg4aQ8C9S8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atg4aQ8C9S8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atg4aQ8C9S8 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atg4aQ8C9S8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms