Protein–RNA interactions for Protein: Q8C9C9

4930507D05Rik, RIKEN cDNA 4930507D05 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930507D05RikQ8C9C9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC9.19□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.18□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC9.18□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC9.18□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Cpeb3-210ENSMUST00000136286 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC9.17□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC9.17□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Adgrb2-202ENSMUST00000097868 4635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.17□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.17□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC9.16□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.16□□□□□ -0.94
4930507D05RikQ8C9C9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC9.16□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms