Protein–RNA interactions for Protein: Q8C460

Eri3, ERI1 exoribonuclease 3, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eri3Q8C460 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eri3Q8C460 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Eri3Q8C460 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.1 ms