Protein–RNA interactions for Protein: Q8C080

Snx16, Sorting nexin-16, mousemouse

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Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx16Q8C080 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
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Snx16Q8C080 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Snx16Q8C080 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Snx16Q8C080 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Snx16Q8C080 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Snx16Q8C080 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Snx16Q8C080 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Snx16Q8C080 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Snx16Q8C080 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Snx16Q8C080 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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Snx16Q8C080 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Snx16Q8C080 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms