Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX09

Rbbp5, Retinoblastoma-binding protein 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp5Q8BX09 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rbbp5Q8BX09 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rbbp5Q8BX09 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms