Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX07

Ctdsp2, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 2, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp2Q8BX07 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ctdsp2Q8BX07 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ctdsp2Q8BX07 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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