Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Catsper4Q8BVN3 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms