Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Snx17Q8BVL3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
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