Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTU1

Cfap20, Cilia- and flagella-associated protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap20Q8BTU1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cfap20Q8BTU1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cfap20Q8BTU1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms