Protein–RNA interactions for Protein: Q8BTQ0

PcgF3, Polycomb group RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcgF3Q8BTQ0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
PcgF3Q8BTQ0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms