Protein–RNA interactions for Protein: Q8BPZ8

Abraxas1, BRCA1-A complex subunit Abraxas 1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abraxas1Q8BPZ8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Abraxas1Q8BPZ8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Abraxas1Q8BPZ8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Abraxas1Q8BPZ8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Abraxas1Q8BPZ8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Abraxas1Q8BPZ8 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Abraxas1Q8BPZ8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Abraxas1Q8BPZ8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Abraxas1Q8BPZ8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abraxas1Q8BPZ8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abraxas1Q8BPZ8 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abraxas1Q8BPZ8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abraxas1Q8BPZ8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abraxas1Q8BPZ8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abraxas1Q8BPZ8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abraxas1Q8BPZ8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abraxas1Q8BPZ8 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abraxas1Q8BPZ8 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abraxas1Q8BPZ8 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abraxas1Q8BPZ8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abraxas1Q8BPZ8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abraxas1Q8BPZ8 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abraxas1Q8BPZ8 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abraxas1Q8BPZ8 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abraxas1Q8BPZ8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abraxas1Q8BPZ8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abraxas1Q8BPZ8 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abraxas1Q8BPZ8 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abraxas1Q8BPZ8 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abraxas1Q8BPZ8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abraxas1Q8BPZ8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abraxas1Q8BPZ8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abraxas1Q8BPZ8 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Abraxas1Q8BPZ8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms