Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP97

Rhbdd3, Rhomboid domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdd3Q8BP97 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rhbdd3Q8BP97 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rhbdd3Q8BP97 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms