Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Grik4Q8BMF5 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Grik4Q8BMF5 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms