Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Usp54Q8BL06 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Usp54Q8BL06 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms