Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKW4

Zcchc4, Zinc finger CCHC domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc4Q8BKW4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Zcchc4Q8BKW4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Zcchc4Q8BKW4 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms