Protein–RNA interactions for Protein: Q8BKI2

Tnrc6b, Trinucleotide repeat-containing gene 6B protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnrc6bQ8BKI2 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tnrc6bQ8BKI2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tnrc6bQ8BKI2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms