Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJL0

Smarcal1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcal1Q8BJL0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Smarcal1Q8BJL0 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms