Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cyp4f39Q8BGU0 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cyp4f39Q8BGU0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cyp4f39Q8BGU0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cyp4f39Q8BGU0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cyp4f39Q8BGU0 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Cyp4f39Q8BGU0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp4f39Q8BGU0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp4f39Q8BGU0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp4f39Q8BGU0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp4f39Q8BGU0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp4f39Q8BGU0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp4f39Q8BGU0 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp4f39Q8BGU0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp4f39Q8BGU0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp4f39Q8BGU0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp4f39Q8BGU0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp4f39Q8BGU0 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp4f39Q8BGU0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp4f39Q8BGU0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp4f39Q8BGU0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp4f39Q8BGU0 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp4f39Q8BGU0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp4f39Q8BGU0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp4f39Q8BGU0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp4f39Q8BGU0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cyp4f39Q8BGU0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cyp4f39Q8BGU0 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cyp4f39Q8BGU0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cyp4f39Q8BGU0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms