Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGI7

Lrrc39, Leucine-rich repeat-containing protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc39Q8BGI7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Lrrc39Q8BGI7 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms