Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Atg4bQ8BGE6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Atg4bQ8BGE6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Atg4bQ8BGE6 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Atg4bQ8BGE6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Atg4bQ8BGE6 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Atg4bQ8BGE6 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Atg4bQ8BGE6 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Atg4bQ8BGE6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Atg4bQ8BGE6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Atg4bQ8BGE6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Atg4bQ8BGE6 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Atg4bQ8BGE6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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