Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Htatsf1Q8BGC0 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Htatsf1Q8BGC0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Htatsf1Q8BGC0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Htatsf1Q8BGC0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Htatsf1Q8BGC0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Htatsf1Q8BGC0 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Htatsf1Q8BGC0 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Htatsf1Q8BGC0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
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