Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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H2-M10.4Q85ZW8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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H2-M10.4Q85ZW8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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H2-M10.4Q85ZW8 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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H2-M10.4Q85ZW8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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H2-M10.4Q85ZW8 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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H2-M10.4Q85ZW8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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H2-M10.4Q85ZW8 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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H2-M10.4Q85ZW8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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H2-M10.4Q85ZW8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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H2-M10.4Q85ZW8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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H2-M10.4Q85ZW8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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H2-M10.4Q85ZW8 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
H2-M10.4Q85ZW8 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
H2-M10.4Q85ZW8 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
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