Protein–RNA interactions for Protein: Q810N9

Ccdc172, Coiled-coil domain-containing protein 172, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc172Q810N9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ccdc172Q810N9 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ccdc172Q810N9 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms