Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZP0

4930503B20Rik, 4930503B20Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930503B20RikQ80ZP0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
4930503B20RikQ80ZP0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms