Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z24

Negr1, Neuronal growth regulator 1, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Negr1Q80Z24 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Negr1Q80Z24 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Negr1Q80Z24 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Negr1Q80Z24 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Negr1Q80Z24 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Negr1Q80Z24 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Negr1Q80Z24 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Negr1Q80Z24 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Negr1Q80Z24 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Negr1Q80Z24 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Negr1Q80Z24 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Negr1Q80Z24 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Negr1Q80Z24 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Negr1Q80Z24 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Negr1Q80Z24 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Negr1Q80Z24 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Negr1Q80Z24 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Negr1Q80Z24 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Negr1Q80Z24 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Negr1Q80Z24 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Negr1Q80Z24 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Negr1Q80Z24 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Negr1Q80Z24 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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