Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

Predictions only

Length 694 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
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Pcsk9Q80W65 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Pcsk9Q80W65 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcsk9Q80W65 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcsk9Q80W65 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcsk9Q80W65 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Pcsk9Q80W65 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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Pcsk9Q80W65 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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