Protein–RNA interactions for Protein: Q80W40

Acsm4, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM4, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsm4Q80W40 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Acsm4Q80W40 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acsm4Q80W40 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acsm4Q80W40 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acsm4Q80W40 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acsm4Q80W40 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acsm4Q80W40 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acsm4Q80W40 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acsm4Q80W40 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acsm4Q80W40 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acsm4Q80W40 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acsm4Q80W40 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Acsm4Q80W40 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acsm4Q80W40 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acsm4Q80W40 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acsm4Q80W40 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acsm4Q80W40 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Acsm4Q80W40 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Acsm4Q80W40 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acsm4Q80W40 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acsm4Q80W40 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acsm4Q80W40 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acsm4Q80W40 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acsm4Q80W40 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acsm4Q80W40 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acsm4Q80W40 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acsm4Q80W40 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acsm4Q80W40 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Acsm4Q80W40 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acsm4Q80W40 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acsm4Q80W40 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acsm4Q80W40 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acsm4Q80W40 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acsm4Q80W40 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acsm4Q80W40 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acsm4Q80W40 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acsm4Q80W40 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acsm4Q80W40 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acsm4Q80W40 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Acsm4Q80W40 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms