Protein–RNA interactions for Protein: Q80W37

Snupn, Snurportin-1, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnupnQ80W37 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SnupnQ80W37 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SnupnQ80W37 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SnupnQ80W37 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SnupnQ80W37 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SnupnQ80W37 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnupnQ80W37 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnupnQ80W37 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnupnQ80W37 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnupnQ80W37 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnupnQ80W37 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnupnQ80W37 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnupnQ80W37 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnupnQ80W37 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnupnQ80W37 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnupnQ80W37 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnupnQ80W37 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnupnQ80W37 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnupnQ80W37 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnupnQ80W37 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnupnQ80W37 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnupnQ80W37 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SnupnQ80W37 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnupnQ80W37 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnupnQ80W37 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnupnQ80W37 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnupnQ80W37 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SnupnQ80W37 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnupnQ80W37 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnupnQ80W37 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnupnQ80W37 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SnupnQ80W37 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms