Protein–RNA interactions for Protein: Q80U93

Nup214, Nuclear pore complex protein Nup214, mousemouse

Predictions only

Length 2,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup214Q80U93 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Nup214Q80U93 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nup214Q80U93 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms