Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Avl9Q80U56 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms