Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSG2

Ctdp1, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 960 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdp1Q7TSG2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ctdp1Q7TSG2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ctdp1Q7TSG2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms